دبیرستان‌های علوم و معارف اسلامی در کشور سه‌گونه هستند که به صورت وابسته اداره می‌شوند:
1- دبیرستان‌های علوم و معارف اسلامی شهید مطهری وابسته به مدرسه‌ی عالی شهید مطهری
2- دبیرستان‌های علوم و معارف اسلامی صدرا وابسته به سازمان تبلیغات اسلامی
3- دبیرستان‌های علوم و معارف اسلامی هدی وابسته به جامعه‌الزهرای قم؛ برخی دیگر از دبیرستان‌ها به صورت غیرانتفاعی اداره می‌شوند. علاوه‌بر اینها برخی نیز به صورت دبیرستان‌های دولتی علوم و معارف اسلامی اداره می‌شوند اما هنوز توسعه‌ی چندانی پیدا نکرده‌اند.
شیوه‌ی تأسیس دبیرستان علوم و معارف اسلامی وابسته به سازمان تبلیغات اسلامی:
